Границы порта Севастополь установлены в части акватории, в пределах которой осуществляется государственное регулирование деятельности в порту.Стоит отметить, что в акваторию порта включили семь участков, которые состоят из акваторий в бухте Севастопольская с каналом и ковшом реки Черной, в бухте Камышовая, акватории в восточной части бухты Балаклавская, операционной акватории у пассажирского причала местных линий, якорных стоянок.Навигация в порту будет осуществляться в течение всего года (круглогодично).В распоряжении также отмечается, что принятое решение направлено на приведение правового статуса порта в соответствие с законодательством России.